Terminata positivamente la prima esperienza di sperimentazione annuale del progetto "Il Giornale in Ateneo", tenutasi nel corso dell'anno accademico 2007-2008, anche per il 2008-2009 l'Osservatorio Permanente Giovani-Editori ha deciso di proseguire con una nuova sperimentazione dell'iniziativa.
Dal mese di Ottobre 2008 è partita una nuova edizione del progetto, con durata annuale, che è andata ad interessare sia il primo che il secondo semestre, offrendo un format molto simile a quello della prima edizione, ben consolidato e forte dei consensi raccolti tra i docenti partecipanti sin dalle prime fasi sperimentali.
A questa nuova edizione hanno partecipato 142 docenti in 75 Atenei.
Nel corso della sesta edizione del Convegno "Crescere tra le righe", organizzato dall' Osservatorio Permanente Giovani-Editori il 22 e 23 maggio 2009, presso il Borgo La Bagnaia, anche una piccola delegazione di studenti universitari, accompagnati dai docenti universitari che hanno fatto parte del Comitato Scientifico del progetto, ha preso parte alla due giorni di lavori.
Giovedì 11 Giugno 2009 si è tenuto a Roma il Seminario conclusivo del progetto "Il Giornale in Ateneo" per l'Anno Accademico 2008/2009. Nel corso di quest'unico appuntamento annuale sono state rendicontate, dalla viva voce di molti dei docenti partecipanti all'iniziativa, le esperienze didattiche maturate nel corso delle ultime due annualità, frutto quindi dell'integrazione della singola didattica con il progetto "Il Giornale in Ateneo".